BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Eche_v2.0_cds.fasta 30,099 sequences; 37,600,338 total letters Query= Untitled_sequence Length=6907 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Contig136g000500.1.mRNA1gene=Contig136g000500.1 5795 0.0 ErcheCG000030.1.mRNA1.mrna1gene=ErcheCG000030.1.mRNA1 150 1e-34 >Contig136g000500.1.mRNA1 gene=Contig136g000500.1 Length=3357 Score = 5795 bits (3138), Expect = 0.0 Identities = 3149/3154 (99%), Gaps = 2/3154 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1 ATTAAACTGAAAGCCCATACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAAGACCATATGCAGATAAC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3152 ATTAAACTGAAAGCCCATACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAAGACCATATGCAGATAAC 3093 Query 61 GAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGAGATGCTTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3092 GAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGAGATGCTTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCAC 3033 Query 121 CCATTAATAGTAATGGAACTCTGTGCAAAGTTTCCTCCAGTAATATGAGTTACCACCCCT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3032 CCATTAATAGTAATGGAACTCTGTGCAAAGTTTCCTCCAGTAATATGAGTTACCACCCCT 2973 Query 181 TGATCACTTATACTACCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2972 TGATCACTTATACTACCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACT 2913 Query 241 ACGGAAATAGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAAGCAGATACT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2912 ACGGAAATAGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAAGCAGATACT 2853 Query 301 TGACATGTTCCTCCTCTTCCCGGTCCATCACAAGGGAAACGAAAACCAAGATTTGCTTTA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2852 TGACATGTTCCTCCTCTTCCCGGTCCATCACAAGGGAAACGAAAACCAAGATTTGCTTTA 2793 Query 361 TCTGGTATTAAACGCGAGCTACGAGCAAATAGAACACCTTTCAACAGTATCAATACCGTC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2792 TCTGGTATTAAACGCGAGCTACGAGCAAATAGAACACCTTTCAACAGTATCAATACCGTC 2733 Query 421 ACATGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACCAAAAAATCTGCTGTTCCTAATGGAATG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2732 ACATGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACCAAAAAATCTGCTGTTCCTAATGGAATG 2673 Query 481 GGTAACAAAGCTACTTTGCCACCCACTGCTACTAACTCACTGCCCCCCCAAGTCAAACTG 540 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2672 GGTAACAAAGCTACTTTTCCACCCACTGCTACTAACTCACCGCCCCCCCAAGTCAAACTG 2613 Query 541 GTGCTCGCTGTTTCACCAGGGGCTGTTACACCAGGTGCTAAAGCATGGGTATTTTGTATC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2612 GTGCTCGCTGTTTCACCAGGGGCTGTTACACCAGGTGCTAAAGCATGGGTATTTTGTATC 2553 Query 601 CATTGAGCAAAGACCGGTTGTAATTGTATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTGTGGACGC 660 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2552 CATTGAGCAAAGACCGGTTGTAATTGTATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTGTGGACGC 2493 Query 661 CCTAAAGCACTCATGGTATCATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGGAAACCTAGAAAT 720 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2492 CCTAAAGCACTCATGGTATCATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGGAAACCTAGAAAT 2433 Query 721 ATACATACCCAGTTGAGATGTGATATGATTGCATCGCGATGCCTTAGGACACGATCTAAT 780 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2432 ATACATACCCAGTTGAGATGTGATATGATTGCATCGCGATGCCTTAGGACACGATCTAAT 2373 Query 781 AAATCGTTATATCGATTAGTTGGATCATAGTCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCA 840 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2372 AAATCGTTATATCGATTAGTTGGATCATAGTCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCA 2313 Query 841 GCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAGTGACAGTTGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2312 GCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAGTGACAGTTGT 2253 Query 901 GTAGCATAGTCAGTAGCTAGATATGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACA 960 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2252 GTAGCATAGTCAGTAGCTAGATATGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACA 2193 Query 961 ATAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAGGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGATGTT 1020 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2192 ATAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAGGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGATGTT 2133 Query 1021 GTTAGAATTTCATATAGGCCTTTATGGCCTTGGCCTGTAAATGGACCTTTATGAGCCTCT 1080 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2132 GTTAGAATTTCATATAGGCCTTTATGGCCTTGGCCTGTAAATGGACCTTTATGAGCCTCT 2073 Query 1081 AAAATATCTTTTATACCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATATGACCCGCAATG 1140 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2072 AAAATATCTTTTATACCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATATGACCCGCAATG 2013 Query 1141 AGGAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCTATATCGGTTAACCATAGACCCCCG 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2012 AGGAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCTATATCGGTTAACCATAGACCCCCG 1953 Query 1201 GTCACTGGATCTAATCCGCCACGAAAAGTAAGAAATTCCGAGTATTTTGACCAATTTAAG 1260 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1952 GTCACTGGATCTAATCCGCCACGAAAAGTAAGAAATTCCGAGTATTTTGACCAATTTAAG 1893 Query 1261 GTAAAAAAAGGGGTTGCTCCTTCAGCAAAACTTGGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCCCGA 1320 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1892 GTAAAAAAAGGGGTTGCTCCTTCAGCAAAACTTGGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCCCGA 1833 Query 1321 TTCAAAATAAATTCATGAGGAAGCGGTATTTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAAT 1380 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1832 TTCAAAATAAATTCATGAGGAAGCGGTATTTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAAT 1773 Query 1381 TGGTTAATCGGTAAAGATACATGTACTTGATGGCCTGCCCAAGAAAGGGACCCAAGTCCT 1440 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1772 TGGTTAATCGGTAAAGATACATGTACTTGATGGCCTGCCCAAGAAAGGGACCCAAGTCCT 1713 Query 1441 AGTAGCCCTGCTAAATGGTGATTCAACATAGATTCTACATCTTGGAACCAAGCCAATTTT 1500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1712 AGTAGCCCTGCTAAATGGTGATTCAACATAGATTCTACATCTTGGAACCAAGCCAATTTT 1653 Query 1501 GGAGCTGCTTTGTGATAATGGAACCAACCAGCAAAAAGCATTAAGGCTGCGAAGACCAAT 1560 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1652 GGAGCTGCTTTGTGATAATGGAACCAACCAGCAAAAAGCATTAAGGCTGCGAAGACCAAT 1593 Query 1561 GCGCCAATTGCGGTACAATAAAGTTGTAATTCACTAGTTATTCCGGATGCTCGCCAAATC 1620 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1592 GCGCCAATTGCGGTACAATAAAGTTGTAATTCACTAGTTATTCCGGATGCTCGCCAAATC 1533 Query 1621 TGAAAAAAGCCAGAGGTTATTTGTATTCCTCGGAAGCCTCCGCCCACATCTCCATTCAGG 1680 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1532 TGAAAAAAGCCAGAGGTTATTTGTATTCCTCGGAAGCCTCCGCCCACATCTCCATTCAGG 1473 Query 1681 ATTTCTTGGCCCACTATTGGCCAAACCACCTGAGCACTAGGTCCAATGTGAGTAGGATCA 1740 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1472 ATTTCTTGGCCCACTATTGGCCAAACCACCTGAGCACTAGGTCCAATGTGAGTAGGATCA 1413 Query 1741 CTCAGCCATGCTTCATAATTGGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCACTCAGCCAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1412 CTCAGCCATGCTTCATAATTGGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCACTCAGCCAA 1353 Query 1801 AGAAAGATGATAGAGAGTTGGCCGAAATGGGCACTAAATACTTTTCGAGAGATTTCCTCC 1860 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1352 AGAAAGATGATAGAGAGTTGGCCGAAATGGGCACTAAATACTTTTCGAGAGATTTCCTCC 1293 Query 1861 AAATCACTGGTATGACTATCAAAATCGTGAGCATCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTG 1920 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1292 AAATCACTGGTATGACTATCAAAATCGTGAGCATCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTG 1233 Query 1921 GTAGTATCAGGTCCCTTAGCTATTGTTCTTGAGAAATGACCGGGTTTAGCCCATTCCTCG 1980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1232 GTAGTATCAGGTCCCTTAGCTATTGTTCTTGAGAAATGACCGGGTTTAGCCCATTCCTCG 1173 Query 1981 AAAGAAGTTTTTATGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTGACTTCTGGTTCCGGCGAACGA 2040 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1172 AAAGAAGTTTTTATGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTGACTTCTGGTTCCGGCGAACGA 1113 Query 2041 ATAATCATTGAGTCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAAACCCGCCAACAGTCAC 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1112 ATAATCATTGAGTCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAAACCCGCCAACAGTCAC 1053 Query 2101 TCAAGTAATTAGTGAACCGATGATAGATACTTAGAATTTTTTTCTTTCTCTTCTATCTGC 2160 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1052 TCAAGTAATTAGTGAACCGATGATAGATACTTAGAATTTTTTTCTTTCTCTTCTATCTGC 993 Query 2161 CATCTATTCATCTATTTTCTTTAGTTATTCACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGACC 2220 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 992 CATCTATTCATCTATTTTCTTTAGTTATTCACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGACC 933 Query 2221 TGGGGCAAGTGTTCGGATCTATTATGACATATCCATAGGGTGCTCAACGGACCCTTTTTT 2280 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 932 TGGGGCAAGTGTTCGGATCTATTATGACATATCCATAGGGTGCTCAACGGACCCTTTTTT 873 Query 2281 TTTAATTAAAAAAAGTTTTCGCGCCTTTACATAGGTACCCAAAGAGCTTTTTTTATAACC 2340 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 872 TATAATTAAAAAAAGTTTTCGCGCCTTTACATAGGTACCCAAAGAGCTTTTTTTATAACC 813 Query 2341 TAATCTAGTGTATTCATATTTCAATTATTAAGTTCCGAAATGTAGCCTAGTTTTTTTTTA 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 812 TAATCTAGTGTATTCATATTTCAATTATTAAGTTCCGAAATGTAGCCTAGTTTTTTTTTA 753 Query 2401 GAGGATATTATCCTATTTCAATAAACGCTTATTAGTCATTACTAAGAAACAGTCTAGTAT 2460 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 752 GAGGATATTATCCTATTTCAATAAACGCTTATTAGTCATTACTAAGAAACAGTCTAGTAT 693 Query 2461 TGATATTTAGTCATTTTCAAATCTCTTTTATTGCTTTTAATAGTCGAAAAGAAAAAATAG 2520 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 692 TGATATTTAGTCATTTTCAAATCTCTTTTATTGCTTTTAATAGTCGAAAAGAAAAAATAG 633 Query 2521 AAAAAACTAGATATATAGATATTCTCATATTCATGTACTACTTACCCCTAGAGGCTACCA 2580 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 632 AAAAAACTAGATATATAGATATTCTCATATTCATGTACTACTTACCCCTAGAGGCTACCA 573 Query 2581 GATTAAATAGAACGATTTGAGAAAAGGATATAATGAAATTTTTTTTCTTTGATTGGTTCT 2640 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 572 GATTAAATAGAACGATTTGAGAAAAGGATATAATGAAATTTTTTTTCTTTGATTGGTTCT 513 Query 2641 TCTGATAGAAAAAAGGATCCGTTTTATTTGACCGAGAGGGCCAAGAAACTAAAAAACGAT 2700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 512 TCTGATAGAAAAAAGGATCCGTTTTATTTGACCGAGAGGGCCAAGAAACTAAAAAACGAT 453 Query 2701 TAATTATAAAAACAAATATATAGAATAAAAAAAAAAAAAGAAACAAGGGGAAAGTTCTTA 2760 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 452 TAATTATAAAAACAAATATATAGAATAAAAAAAAAAA--GAAACAAGGGGAAAGTTCTTA 395 Query 2761 TTCGAAGCGCCTCGTGATCGTCAACCAATTCTGTGCTTCAATATAATTACCAGGAGTAAG 2820 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 394 TTCGAAGCGCCTCGTGATCGTCAACCAATTCTGTGCTTCAATATAATTACCAGGAGTAAG 335 Query 2821 CGTTATAGCCTGTTTCCAATACTGAGCGGCTTGAGCGAACCAAGCCTCCGCCATTTCAGA 2880 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 334 CGTTATAGCCTGTTTCCAATACTGAGCGGCTTGAGCGAACCAAGCCTCCGCCATTTCAGA 275 Query 2881 ATCTCCTTGTTGAATGGCCTGTTCTCCACGGTCGGAATAGGCGGGTCAATTCCCTCCCTG 2940 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 274 ATCTCCTTGTTGAATGGCCTGTTCTCCACGGTCGGAATAGGCGGGTCAATTCCCTCCCTG 215 Query 2941 AGAACCGTACTTGAGAGTTTCCTACCTCATACGGCTCGACAACCAACTCTTTTGTTTCGG 3000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 214 AGAACCGTACTTGAGAGTTTCCTACCTCATACGGCTCGACAACCAACTCTTTTGTTTCGG 155 Query 3001 TGTACCAGTTTTTTAACTTTAACCTACTTTGAACTTTATATCTAATTGAATGTCTAATTG 3060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 154 TGTACCAGTTTTTTAACTTTAACCTACTTTGAACTTTATATCTAATTGAATGTCTAATTG 95 Query 3061 AATGAGATTTCTTATAGATATTTTGTTTTTCTTGGATTAAACAAAAGAGAGTAATTACAT 3120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 94 AATGAGATTTCTTATAGATATTTTGTTTTTCTTGGATTAAACAAAAGAGAGTAATTACAT 35 Query 3121 GAGTTTCAAACTTTCATTTTGATTTAATTAATAT 3154 |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 34 GAGTTTCAAACTTTCATTTTGATTTAATTAATAT 1 >ErcheCG000030.1.mRNA1.mrna1 gene=ErcheCG000030.1.mRNA1 Length=2205 Score = 150 bits (81), Expect = 1e-34 Identities = 111/126 (88%), Gaps = 0/126 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1070 TATGAGCCTCTAAAATATCTTTTATACCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATAT 1129 |||| || ||||||| ||||||||||| || || || || |||| || |||||||||| Sbjct 925 TATGTGCTTCTAAAAGATCTTTTATACTGTGTCCGATTCCAAAGTTCGTTCTATACATAT 866 Query 1130 GACCCGCAATGAGGAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCTATATCGGTTAACC 1189 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || Sbjct 865 GACCCGCAATGAGGAAAAGAATTGCGATAGCTAAATGATGATGTGCCATATCGGTTAGCC 806 Query 1190 ATAGAC 1195 ||| || Sbjct 805 ATAAAC 800 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 253099135200 Database: Eche_v2.0_cds.fasta Posted date: Jul 17, 2024 4:51 PM Number of letters in database: 37,600,338 Number of sequences in database: 30,099 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5