BLASTN 2.11.0+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: Eche_v2.0_cds.fasta 30,099 sequences; 37,600,338 total letters Query= Untitled_sequence Length=2310 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value Contig16g000540.1.mRNA1gene=Contig16g000540.1 4150 0.0 Contig16g000545.mRNA1gene=Contig16g000545 595 4e-169 >Contig16g000540.1.mRNA1 gene=Contig16g000540.1 Length=3093 Score = 4150 bits (2247), Expect = 0.0 Identities = 2291/2311 (99%), Gaps = 7/2311 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 GTGGGCGAACGACGGGAATTGAACCCGCGATGGTGAATTCACAATCCACTGCCTTAATCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 123 GTGGGCGAACGACGGGAATTGAACCCGCGATGGTGAATTCACAATCCACTGCCTTAATCC 182 Query 61 ACTTGGCTACATCCGCCCCTACTCTACTCTACTATACTATAATCTATTCTTTTTTGTATT 120 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 183 ACTTGGCTACATCCGCCCCTACTCTACTC-----TACTATAATCTATTCTTTTTTGTATT 237 Query 121 GTCTAAAATAAAAACACACAGATTTCAATAAAAAAGGTAGCAAATTCCACCTTACTTTTT 180 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 238 GTCTAAAATAAAAACACATAGATTTCAATAAAAAAGGTAGAAAATTCCACCTTACTTTTT 297 Query 181 TTCTAAAGTAAAAAATTATAGTAGTACTTTTATATTAATATAAAAGAAAAATATGATACT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 298 TTCTAAAGTAAAAAATTATAGTAGTACTTTTATATTAATATAAAAGAAAAATATGATACT 357 Query 241 CTATAAAATAAAAATTTGCTCGTTTTTATAGCAAAAAAACGAGCAATATAAGCCTT-TTT 299 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 358 CTATAAAATAAAAATTTGCTCGTTTTTATAGAAAAAAAACGAGCAATATAAGCCTTCTTT 417 Query 300 TAAATTAAAAAGAAGGCTTATATTGCTCGTTTTTTACTAAACTAGATCTAGACTAACGCT 359 | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 418 TTAATTTAAAA-AAGGCTTATATTGCTCGTTTTTTACTAAACTAGATCTAGACTAACACT 476 Query 360 CTAACACTAAGGAATTATCCGTTTGTAGATGGAGCCTCAACAGCAGCTAGGTCTAGAGGG 419 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 477 CTAACACTAAGGAATTATCCGTTTGTAGATGGAGCCTCAACAGCAGCTAGGTCTAGAGGG 536 Query 420 AAGTTGTGAGCATTACGTTCATGCATAACTTCCATACCAAGGTTAGCACGGTTAATAATA 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 AAGTTGTGAGCATTACGTTCATGCATAACTTCCATACCAAGGTTAGCACGGTTAATAATA 596 Query 480 TCAGCCCAAGTATTAATAACACGTCCTTGACTATCAACTACTGATTGGTTGAAATTGAAA 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 TCAGCCCAAGTATTAATAACACGTCCTTGACTATCAACTACTGATTGGTTGAAATTGAAA 656 Query 540 CCATTTAGGTTGAAAGCCATAGTACTAATACCTAAAGCAGTAAACCAAATACCTACTACC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 657 CCATTTAGGTTGAAAGCCATAGTACTAATACCTAAAGCAGTAAACCAAATACCTACTACC 716 Query 600 GGCCAAGCCGCTAAGAAGAAATGTAAAGAACGAGAATTGTTGAAACTAGCATATTGGAAG 659 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 GGCCAAGCCGCTAAGAAGAAATGTAAAGAACGAGAATTGTTGAAACTAGCATATTGGAAG 776 Query 660 ATCAATCGGCCAAAATAACCGTGAGCAGCTACAATGTTGTAAGTTTCTTCTTCTTGCCCG 719 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 ATCAATCGGCCAAAATAACCGTGAGCAGCTACAATGTTGTAAGTTTCTTCTTCTTGCCCG 836 Query 720 AATCTGTAACCTTCATTAGCAGATTCATTTTCTGTGGTTTCCCTGATCAAACTAGAAGTT 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 AATCTGTAACCTTCATTAGCAGATTCATTTTCTGTGGTTTCCCTGATCAAACTAGAAGTT 896 Query 780 ACCAAGGAACCATGCATAGCACTAAATAGGGAGCCGCCGAATACACCAGCTACACCTAAC 839 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 897 ACCAAGGAACCATGCATAGCACTAAACAGGGAGCCGCCGAATACACCAGCTACACCTAAC 956 Query 840 ATGTGAAATGGGTGCATAAGAATGTTGTGCTCAGCCTGGAATACAATCATAAAGTTGAAA 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 ATGTGAAATGGGTGCATAAGAATGTTGTGCTCAGCCTGGAATACAATCATAAAGTTGAAA 1016 Query 900 GTACCAGATATTCCTAGAGGCATACCATCAGAAAAACTTCCCTGACCAATTGGATAGATC 959 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 GTACCAGAGATTCCTAGAGGCATACCATCAGAAAAACTTCCCTGACCAATTGGATAGATC 1076 Query 960 AAGAAAACAGCAGTCGCAGCTGCAACAGGAGCTGAATATGCAACAGCAATCCAAGGACGC 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 AAGAAAACAGCAGTCGCAGCTGCAACAGGAGCTGAATATGCAACAGCAATCCAAGGACGC 1136 Query 1020 ATACCCAGACGGAAACTAAGTTCCCACTCACGACCCATATAACAAGCTACACCAAGTAAA 1079 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 ATACCCAGACGGAAACTAAGTTCCCACTCACGACCCATATAACAAGCTACACCAAGTAAA 1196 Query 1080 AAGTGTAGAACAATTAGTTCATAAGGACCACCGTTGTATAGCCATTCATCAACGGATGCA 1139 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 AAGTGTAGAACAATTAGTTCATAAGGACCACCGTTGTATAGCCATTCATCAACGGATGCA 1256 Query 1140 GCTTCCCAGATCGGGTAAAAATGCAAACCAATAGCTGCAGAAGTAGGAATAATGGCACCG 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 GCTTCCCAGATCGGGTAAAAATGCAAACCAATAGCTGCAGAAGTAGGAATAATGGCACCG 1316 Query 1200 GAAATAATATTGTTTCCGTAAAGAAGAGATCCAGAAACAGGTTCACGAATACCATCAATA 1259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 GAAATAATATTGTTTCCGTAAAGAAGAGATCCAGAAACAGGTTCACGAATACCATCAATA 1376 Query 1260 TCTACTGGAGGAGCAGCAATGAATGCGATAATAAAAACGGAAGTTGCGGTCAATAAGGTA 1319 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1377 TCTACTGGAGGAGCAGCAATGAATGCGATAATAAAAACGGAAGTTGCGGTCAATAAGGTA 1436 Query 1320 GGGATCATCAAAACACCAAACCATCCGATGTAAAGACGGTTTTCAGTGCTGGTTATCCAG 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 GGGATCATCAAAACACCAAACCATCCGATGTAAAGACGGTTTTCAGTGCTGGTTATCCAG 1496 Query 1380 TTACAGAAGCGACCCCATAGGTTTTCGCTTTCGCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATGGTA 1439 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 TTACAGAAGCGACCCCATAGGTTTTCGCTTTCGCGTCTCTCTAAAATTGCAGTCATGGTA 1556 Query 1440 AAATCCTTGGTTTATTTAATCATCAGGGACTCCCAAGCGCACAAATTCTCTAAAACTATA 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1557 AAATCCTTGGTTTATTTAATCATCAGGGACTCCCAAGCGCACAAATTCTCTAAAACTATA 1616 Query 1500 AGTAGATAATTGAGAGCTTGTTATTGAACAGTATAACATGACTTATATAGCCATGTCAAC 1559 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 AGTAGATAATTGAGAGCTTGTTATTGAACAGTATAACATGACTTATATAGCCATGTCAAC 1676 Query 1560 CAATGTAAAATGGATAAGATCCTTTTAGTTTAGATTCATAATAAATTTTTTTTAATCGAT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1677 CAATGTAAAATGGATAAGATCCTTTTAGTTTAGATTCATAATAAATTTTTTTTAATCGAT 1736 Query 1620 GAAATCAATTAGAAGCGAATCCACATACATACAAATAGAATTGCTCTATGAATATTATTT 1679 ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 1737 GAAATAAATTAGAAGCGAATCCACATACATACAAATAGAATGGCTCCATGAATATTATTT 1796 Query 1680 CCAAATCATATGAATATGATCCATAGTGGGTTGCCCGGGACTCGAACCCGGAACTAGTCG 1739 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 CCAAATCATATGAATATGATCCATAGTGGGTTGCCCGGGACTCGAACCCGGAACTAGTCG 1856 Query 1740 GATGGAGTAGATAATTTCCTTGTTAAAATGAAAAAAAAAGGTAAAAAACCCCTCCCCAAA 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1857 GATGGAGTAGATAATTTCCTTGTTAAAATGAAAAAAAAAGGTAAAAAACCCCTCCCCAAA 1916 Query 1800 CCGTGCTTGCATTTTTCATTGCACACAGCTTTCTCTATGTATACATAGAAAACTCAGTTT 1859 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1917 CCGTGCTTGCATTTTTCATTGCACACAGCTTTCTCTATGTATACATAGAAAACTCAGTTT 1976 Query 1860 CTTTGGTTCCTTATAAATAGGACGCCAAATTCAATACTCAGTAAATTTAATCGTAGTCTT 1919 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 CTTTGGTTCCTTATAAATAGGACGCCAAATTCAATACTCAGTAAATTTAATCGTAGTCTT 2036 Query 1920 ACTGTATGAACATTTAATAATAGAAATAAAAAACTTTTGATAATCAAAAATAATTGATTT 1979 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 2037 ACTGGATGAACATTTAATAATAGAAATAAAAAACTTTTGATAATAAAAAATAATTGATTT 2096 Query 1980 TTTTGTTATCTCCGCATAAATTATGATAAATTTCGATTTCATTTATGGGGTCTCAGAACC 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2097 TTTTGTTATCTCCGCATAAATTATGATAAATTTCGATTTCATTTATGGGGTCTCAGAACC 2156 Query 2040 CAATTATTCATGATTGACCAAATCATTAAGATAAAGAATATCCAAATACCAAATTCGCAC 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2157 CAATTATTCATGATTGACCAAATCATTAAGATAAAGAATATCCAAATACCAAATTCGCAC 2216 Query 2100 TCGATATAATCTTTTAGAAGCATAATAACTTCTTGGGAAGATTAAAGAAAGAACTTGGTC 2159 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2217 TCGATATAATCTTTTAGAAGCATAATAACTTCTTGGGAAGATTAAAGAAAGAACTTGGTC 2276 Query 2160 TTCCCCCGTAAGGAATTCTTCCAATAAACCCGAGCCCAACCTTTTTAAAAAAGCGCGTAC 2219 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2277 TTCCCCCGTAAGGAATTCTTCCAATAAACCCGAGCCCAACCTTTTTAAAAAAGCGCGTAC 2336 Query 2220 AGTACTTTTGTGTTTACGAGCCAAAGTTTTAACACAACAAAGACGAAGTATATATTTTAT 2279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2337 AGTACTTTTGTGTTTACGAGCCAAAGTTTTAACACAACAAAGACGAAGTATATATTTTAT 2396 Query 2280 TCGATATAAATTCTTTTTTTTTGAAGATCCG 2310 ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2397 TCGATATAAATTCTTTTTTTTTGAAGATCCG 2427 Score = 113 bits (61), Expect = 5e-24 Identities = 61/61 (100%), Gaps = 0/61 (0%) Strand=Plus/Minus Query 274 AAAAAACGAGCAATATAAGCCTTTTTTAAATTAAAAAGAAGGCTTATATTGCTCGTTTTT 333 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 451 AAAAAACGAGCAATATAAGCCTTTTTTAAATTAAAAAGAAGGCTTATATTGCTCGTTTTT 392 Query 334 T 334 | Sbjct 391 T 391 >Contig16g000545.mRNA1 gene=Contig16g000545 Length=1635 Score = 595 bits (322), Expect = 4e-169 Identities = 322/322 (100%), Gaps = 0/322 (0%) Strand=Plus/Minus Query 1989 CTCCGCATAAATTATGATAAATTTCGATTTCATTTATGGGGTCTCAGAACCCAATTATTC 2048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1635 CTCCGCATAAATTATGATAAATTTCGATTTCATTTATGGGGTCTCAGAACCCAATTATTC 1576 Query 2049 ATGATTGACCAAATCATTAAGATAAAGAATATCCAAATACCAAATTCGCACTCGATATAA 2108 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1575 ATGATTGACCAAATCATTAAGATAAAGAATATCCAAATACCAAATTCGCACTCGATATAA 1516 Query 2109 TCTTTTAGAAGCATAATAACTTCTTGGGAAGATTAAAGAAAGAACTTGGTCTTCCCCCGT 2168 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1515 TCTTTTAGAAGCATAATAACTTCTTGGGAAGATTAAAGAAAGAACTTGGTCTTCCCCCGT 1456 Query 2169 AAGGAATTCTTCCAATAAACCCGAGCCCAACCTTTTTAAAAAAGCGCGTACAGTACTTTT 2228 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1455 AAGGAATTCTTCCAATAAACCCGAGCCCAACCTTTTTAAAAAAGCGCGTACAGTACTTTT 1396 Query 2229 GTGTTTACGAGCCAAAGTTTTAACACAACAAAGACGAAGTATATATTTTATTCGATATAA 2288 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1395 GTGTTTACGAGCCAAAGTTTTAACACAACAAAGACGAAGTATATATTTTATTCGATATAA 1336 Query 2289 ATTCTTTTTTTTTGAAGATCCG 2310 |||||||||||||||||||||| Sbjct 1335 ATTCTTTTTTTTTGAAGATCCG 1314 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 84091772976 Database: Eche_v2.0_cds.fasta Posted date: Jul 17, 2024 4:51 PM Number of letters in database: 37,600,338 Number of sequences in database: 30,099 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5